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Des Anticorps utilisés pour comprendre la sélection naturelle.

publié le , mis à jour le

Comprendre et décrire le résultat de la sélection de populations de mutants soumis à une pression de sélection donnée a des implications dans de nombreux domaines, de la compréhension fondamentale des systèmes immunitaires à la construction de banques de protéines d’intérêts thérapeutique.

En utilisant un système modèle, la partie d’un anticorps impliquée dans la liaison aux antigènes, et une technique de sélection in vitro couplée aux nouvelles technologies de séquençage, nous avons montré qu’il était possible et informatif de traiter les résultats de la sélection au moyen de la théorie statistique des valeurs extrêmes. Deux paramètres suffisent à décrire le résultat de la sélection dont un paramètre, le paramètre de forme, qui définit à lui seul les écarts de sélectivité entre mutants ainsi que le potentiel de la banque à contenir un meilleur mutant lorsque sa diversité est augmentée.

De plus, nous avons comparé différentes banques construites à partir de structures d’anticorps distinctes et contenant la même diversité. Un résultat inattendu que nous avons observé est qu’il existe une hiérarchie marquée entre les banques pour la liaison à une cible donnée lorsque l’on met en compétition toutes les banque ensemble : de nombreux clones de la meilleure banque dominent les meilleurs clones de toutes les autres banques. Si l’on retire cette banque de la compétition, de nombreux clones d’une autre banque dominent tous les autres. Il semble ainsi que la structure protéique sur laquelle la banque est construite joue un rôle plus important que celui des acides aminés randomisés qui entrent directement en interaction avec la cible. Ceci a des implications cruciales par exemple dans le design des banques pour effectuer une sélection, et dans la compréhension des propriétés des structures des anticorps vis-à-vis de leur potentiel sélectif et évolutif lors de la réponse immunitaire.

Ces résultats viennent d’être publié dans la revue PNAS.